近十年，針對(duì)RET、BRAF、ALK、ROS1、NTRK等融合基因的靶向藥物陸續(xù)在國(guó)內(nèi)外獲批上市并應(yīng)用于臨床，為腫瘤患者帶來(lái)了更多的治療機(jī)會(huì)，顯著改善了攜帶融合基因變異患者的生存質(zhì)量和預(yù)后。
迪安診斷于近日正式推出實(shí)體腫瘤RNA融合26基因組織檢測(cè)產(chǎn)品，該檢測(cè)嚴(yán)格遵循多個(gè)國(guó)內(nèi)外權(quán)威臨床指南和專家共識(shí)要求，通過(guò)基于RNA-seq的檢測(cè)技術(shù)，對(duì)26個(gè)融合基因的220余種融合形式進(jìn)行精準(zhǔn)識(shí)別。
產(chǎn)品具備覆蓋癌種全面、檢測(cè)性能高、解讀專業(yè)性強(qiáng)三大核心優(yōu)勢(shì)，面向腫瘤患者，在靶向治療指導(dǎo)、預(yù)后評(píng)估支持等方面，助力臨床個(gè)性化精準(zhǔn)診療。此外，產(chǎn)品還特別優(yōu)化了對(duì)低質(zhì)量FFPE樣本的兼容性，解決臨床中因樣本降解導(dǎo)致的檢測(cè)難題。
什么是基因融合
基因融合是通過(guò)染色體反轉(zhuǎn)、串聯(lián)復(fù)制、缺失或易位，造成兩個(gè)不同基因的部分序列或全部序列首尾相連，置于同一套調(diào)控序列（包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、核糖體結(jié)合序列、終止子等）控制之下，形成一個(gè)新的嵌合基因（即融合基因）的過(guò)程（圖1）。該嵌合基因編碼產(chǎn)生的融合蛋白能夠介導(dǎo)癌癥的發(fā)生發(fā)展。
圖1 融合基因形成過(guò)程（圖片來(lái)源：tumorfusions.org/）
基因融合與各種疾病，尤其是與癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。融合基因常見于血液腫瘤和實(shí)體瘤中，實(shí)體瘤的呼吸系統(tǒng)腫瘤和乳腺腫瘤中融合基因出現(xiàn)數(shù)量相對(duì)更多。
目前，常用的融合基因檢測(cè)方法包括熒光原位雜交、免疫組織化學(xué)、即時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)和二代測(cè)序等。
權(quán)威指南共識(shí)強(qiáng)烈倡導(dǎo)DNA+RNA檢測(cè)
《NCCN臨床實(shí)踐指南：非小細(xì)胞肺癌》提出，基于RNA水平的NGS (RNA-based NGS) 檢測(cè)可能會(huì)提高ROS1、RET、NTRK1/2/3基因融合和MET基因14號(hào)外顯子跳躍突變（MET 14跳讀）的檢出率。該指南同時(shí)指出，對(duì)于在廣泛組合的檢測(cè)中未發(fā)現(xiàn)驅(qū)動(dòng)基因（指對(duì)腫瘤發(fā)生發(fā)展起到推動(dòng)作用的基因）的患者（尤其是非吸煙者），考慮采用RNA-based NGS檢測(cè)，以最大程度地發(fā)現(xiàn)融合基因突變（圖2）。
圖2 《NCCN臨床實(shí)踐指南：非小細(xì)胞肺癌》分子檢測(cè)推薦
《基于RNA-based NGS檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌融合基因臨床實(shí)踐中國(guó)專家共識(shí)》建議，有條件的醫(yī)療機(jī)構(gòu)對(duì)非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC) 樣本進(jìn)行一次性同步RNA-based NGS與DNA-based NGS的驅(qū)動(dòng)基因變異（融合/突變）檢測(cè)【強(qiáng)烈推薦】（圖3）。
圖3 《基于RNA-based NGS檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌融合基因臨床實(shí)踐中國(guó)專家共識(shí)》推薦情況
《非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測(cè)臨床實(shí)踐中國(guó)專家共識(shí)（2023版）》指出，對(duì)于能夠獲取組織學(xué)或細(xì)胞學(xué)樣本的NSCLC患者，推薦使用二代測(cè)序或qRTPCR 進(jìn)行檢測(cè)（強(qiáng)烈推薦），對(duì)于檢出罕見融合伴侶、外顯子斷點(diǎn)融合、基因間融合或驅(qū)動(dòng)基因檢測(cè)為陰性的，建議通過(guò)RNA二代測(cè)序驗(yàn)證（圖4）。
圖4 《非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測(cè)臨床實(shí)踐中國(guó)專家共識(shí)（2023版）》融合基因檢測(cè)推薦
《中國(guó)實(shí)體瘤NTRK融合基因臨床診療專家共識(shí)》指出，RNA-NGS比DNA-NGS panel具有更高的靈敏性，RNA-NGS或者轉(zhuǎn)錄組可作為NTRK融合基因檢測(cè)的重要補(bǔ)充手段（圖5）。
圖5 《中國(guó)實(shí)體瘤NTRK融合基因臨床診療專家共識(shí)》推薦情況
實(shí)體腫瘤RNA融合26基因組織檢測(cè)
迪安診斷臨床基因組中心研發(fā)的實(shí)體腫瘤RNA融合26基因組織檢測(cè)產(chǎn)品，利用RNA-seq檢測(cè)技術(shù)，具有靈敏度高、特異性強(qiáng)等特點(diǎn)，可以準(zhǔn)確高效地檢測(cè)到真實(shí)、低頻的融合變異。
優(yōu)勢(shì)一：覆蓋癌種全面
該產(chǎn)品覆蓋對(duì)融合檢測(cè)有需求的常見癌種，比如肺癌、甲狀腺癌、膽管癌、胰腺癌、膠質(zhì)瘤等；包含與實(shí)體瘤診斷、預(yù)后或治療密切相關(guān)的26個(gè)融合基因的220多種融合形式；可靈活選擇其他檢測(cè)項(xiàng)目進(jìn)行組合檢測(cè)，滿足不同的臨床需求。
優(yōu)勢(shì)二：檢測(cè)性能高
該產(chǎn)品在提高檢測(cè)性能方面，以臨床基因組中心幾千例真實(shí)世界中的石蠟組織包埋樣本（FFPE樣本）的RNA質(zhì)量分布特征為參考，在擴(kuò)增子長(zhǎng)度方面開展多輪優(yōu)化，可實(shí)現(xiàn)低質(zhì)量FFPE RNA樣本的高成功率擴(kuò)增。通過(guò)對(duì)建庫(kù)體系的優(yōu)化，能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)起始量低至10ng的RNA樣本進(jìn)行建庫(kù)且成功率高達(dá)100%，這對(duì)小樣本和穿刺樣本極為友好。
另外，借助調(diào)整內(nèi)參基因組合實(shí)現(xiàn)對(duì)檢測(cè)體系的監(jiān)控，確保檢測(cè)體系穩(wěn)定可靠。其檢測(cè)靈敏度高，可以穩(wěn)定檢測(cè)最低1 copy/ng的融合變異。在1-10 copies/ng的標(biāo)準(zhǔn)品測(cè)試中，靈敏度達(dá)到99.17%，特異性100%（圖6），在檢測(cè)低豐度融合突變方面具有優(yōu)勢(shì)。
圖6 標(biāo)準(zhǔn)品檢測(cè)結(jié)果
優(yōu)勢(shì)三：解讀專業(yè)性強(qiáng)
迪安診斷已建立包括1300多個(gè)基因的實(shí)體瘤解讀數(shù)據(jù)庫(kù)，由專業(yè)的遺傳分析師進(jìn)行定期更新，納入最新的臨床進(jìn)展。
在靶向治療方面，納入各癌種相關(guān)的靶向治療基因，涵蓋FDA/NMPA獲批或指南共識(shí)推薦的檢測(cè)基因；同時(shí)可提供免疫治療、腫瘤遺傳風(fēng)險(xiǎn)、分子分型及預(yù)后解讀，為臨床醫(yī)生及患者提供選擇依據(jù)。
迪安診斷臨床基因組中心
迪安診斷是國(guó)家首批腫瘤診斷與治療項(xiàng)目高通量基因測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用試點(diǎn)單位、首批基因檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用示范中心。
迪安診斷臨床基因組中心嚴(yán)格按照ISO 15189認(rèn)可和CAP認(rèn)證要求進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范的管理，具備自主研發(fā)、樣本檢測(cè)、生信分析、報(bào)告解讀、遺傳咨詢等綜合能力，積極參加并高水平通過(guò)NCCL、CAP、EMQN等多項(xiàng)高通量測(cè)序室間質(zhì)評(píng)。中心開發(fā)了基于全外顯子測(cè)序、家系全外顯子測(cè)序以及全基因組測(cè)序的遺傳病分析服務(wù)，能夠助力各類遺傳性疾病的篩查與診斷。
參考文獻(xiàn)：
1. National Comprehensive Cancer Network. Non-Small Cell Lung Cancer Clinical Practice Guidelines (2025.V3).
https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/nscl.pdf
2. 基于RNA-based NGS檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌融合基因臨床實(shí)踐中國(guó)專家共識(shí)。中國(guó)肺癌雜志2023年11月第26卷第11期ChinJLung Cancer,November 2023,Vol.26,No.11；DOI:10.3779/i.issn.1009-3419.2023.102.43
3. 非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測(cè)臨床實(shí)踐中國(guó)專家共識(shí)（2023版）[J]. 中華病理學(xué)雜志, 2023, 52(6): 565-573. DOI: 10.3760/cma.j.cn112151-20221111-00946.
4. XU, Chunwei, et al. Expert consensus on the diagnosis and treatment of NTRK gene fusion solid tumors in China. Thoracic cancer, 2022, 13.21: 3084-3097.
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